光操作技術では、光を照射している期間全体にわたって、神経細胞を活性化/不活性化できます（図17）。通常、こうした光操作の介入の時間タイミングは、実験者が設定します。しかし、本来の一つ一つの神経活動は、様々なタイミングで一過的に生じて、ミリ秒単位で完結する現象です。

よって、必要なミリ秒の期間以外の期間に、光刺激による活動操作を続けることは、標的の神経活動以外の時間帯への非選択的な介入であり、実験結果の解釈を難しくしてしまいます。